Državno odvjetništvo pokrenulo je pretkazneni postupak protiv Petra Kljajića na temelju kaznene prijave osječkog Centra za mir, nenasilje i ljudska prava. Centar Kljajića sumnjiči za ratni zločin protiv civilnog stanovništva, odnosno da je kao predsjednik Vojno-stambene komisije naređivao nasilno izbacivanje građana srpske nacionalnosti iz njihovih domova. Glavni državni odvjetnik Mladen Bajić na zahtjev Centra izuzeo je iz postupka Županijski sud u Osijeka na kojem Kljajić danas obnaša dužnost istražnog suca i slučaj prenio Županijskom sudu u Čakovcu. Iz Centra tvrde da imaju 36 dokumentiranih slučajeva nasilnog izbacivanja iz stanova. Petar Kljajić tvrdi da nije obaviješten o kaznenoj prijavi protiv njega istaknuvši da su priče o protjerivanjima neutemeljene te dodavši kako je u inkriminirano vrijeme u Osijeku poginulo više od tisuću ljudi. Više od 30 tisuća prognanika imalo je problema sa smještajem, a on je samo raspoređivao stanove koji su ostali prazni nakon odlaska stanara na neprijateljsku stranu.